ساعاتی پس از هشدار فوری ارتش اسرائیل به ساکنان ناحیه‌ای در محدوده شهرهای اراک و خنداب در بامداد روز پنجشنبه ۲۹ خرداد کاربران در شبکه‌های اجتماعی از شنیدن صدای انفجار در مسیر بین دو شهر خبر داده‌اند.
ارتش اسرائيل روز پنجشنبه اعلام کرد که به تاسیسات هسته‌ای آب سنگین اراک حمله هوایی کرد. ارتش اسرائیل گفت راکتور آب تاسیسات اراک فعال نبوده است اما می‌تواند پلوتونیوم مورد نیاز سلاح هسته‌ای را تولید کند.
تصاویری نیز از آسمان پر از دود در این مناطق منتشر شده است و بسیاری می‌گویند به دلیل اختلال گسترده در اینترنت قادر به انتشار سریع تصاویر نیستند.
در تصویر ماهواره‌ای منتشر شده در هشدار ارتش اسرائیل، تأسیساتی مشابه مجتمع آب سنگین اراک (خنداب) که از نگرانی‌های مهم جهانی در مورد برنامه هسته‌ای جمهوری اسلامی بود نشان داده شده بود. این تاسیسات در حدود ۷۵ کیلومتری شمال غرب اراک و در ۵ کیلومتری خنداب و ۲۵۰ کیلومتری جنوب‌غربی تهران قرار دارد.
شماری از رسانه‌های داخل ایران نیز هدف قرار گرفتن تأسیسات آب سنگین اراک را تأیید کرده‌اند و می‌گویند مجتمع تخلیه شده بود و ادعا کرده‌اند که نگرانی در مورد تششعات احتمالی وجود ندارد.
آب سنگین به خنک کردن راکتورهای هسته‌ای کمک می‌کند، اما در فرآیند آن پلوتونیوم نیز به عنوان محصول جانبی تولید می‌شود که می‌تواند در ساخت سلاح هسته‌ای مورد استفاده قرار گیرد.
جمهوری اسلامی طبق توافق هسته‌ای سال ۲۰۱۵ خود با قدرت‌های جهانی موافقت کرده بود که این تأسیسات را برای رفع نگرانی‌ها درباره گسترش تسلیحات هسته‌ای مجدد طراحی کند.
اسرائيل از روز جمعه ۲۳ خرداد تاکنون به تأسیسات مهم نظامی در ایران از جمله پایگاه‌ها، مراکز تولید سلاح، پرتابگرهای موشک، سامانه‌های پدافند هوایی، و همچنین به زیرساخت‌های هسته‌ای نظیر تاسیسات نطنز، زیرساخت‌های انرژی از جمله پارس جنوبی و مراکز و بسیاری مناطق دیگر در چندین استان ایران حمله کرده است. آژانس بین المللی انرژی هسته‌ای، از نهادهای سازمان ملل متحد گفته است احتمالا سانتریفوژهای نطنز در بخش زیرزمین نیز به شدت آسیب دیده‌اند.
آژانس بین‌المللی انرژی اتمی می‌گوید که دو مرکز تولید سانتریفیوژ جمهوری اسلامی نیز هدف حمله قرار گرفته است.
این نهاد نظارتی سازمان ملل متحد روز چهارشنبه با انتشار مطلبی در حساب رسمی خود در شبکه اجتماعی ایکس اعلام کرد اطلاعاتی در اختیار دارد که نشان می‌دهد دو مرکز تولید سانتریفیوژ جمهوری اسلامی، یعنی «کارگاه تسا در کرج و مرکز تحقیقات هسته‌ای تهران» هدف قرار گرفته‌اند.
سانتریفیوژها از تجهیزات اصلی در فرآیند غنی‌سازی اورانیوم و تولید احتمالی سلاح هسته‌ای به شمار می‌روند.
اسرائيل برنامه هسته‌ای جمهوری اسلامی را تهدیدی علیه موجودیت خود می‌داند. جمهوری اسلامی از زمان تاسیس خود شعار نابودی اسرائيل را داده و از گروه‌های مختلف برای حمله به اسرائيل حمایت مالی و تسلیحاتی کرده است.